高精密电主轴具有广泛的应用范围，但其也存在许多的问题。在这其中，热稳定性是一个待解决的关键问题。为什么高精密电主轴会出现热稳定性问题？如何克服？因为电主轴是由电主轴的组合而制成，所以毫无疑问是在结构上增加了一个热源。散热主要包括定子绕组的损耗。定子绕组产生的热量占电机总热量的三分之二以上。

高精密电主轴的热辐射和传热使得电主轴轴承需要得到合理的润滑和冷却，否则电主轴的高速运转无法得到保障。电机的冷却对于提高电主轴的热性能较为重要。在电机定子与外壳的连接处设计有循环冷却水套。水是由低热阻材料制成的，套筒外圈设有螺旋形水箱。当电动机运行时，循环冷却水进入水箱。严格控制冷却水的入口温度，保障一定的压力和流量，可以提高冷却的作用。为了防止电机发热对电主轴轴承的影响，电主轴要采用高热阻材料，使电机转子的热量主要通过气隙传递给传动轴，冷却水使传动轴保持高精密电主轴的热稳定性平衡。

为了克服上述两种预紧方法的缺点，高精密电主轴可以在超高速加工中心的主轴单元中采用开关式预紧方法，使电主轴单元既能适应低转速和高负荷的加工，又能适应超高速加工的需要。在低速重切削时，轴承工作在恒定的方位预紧力下；在高速轻切削时，系统可以主动切换到恒力预紧模式，避免预紧力的增加，提高轴承的高速性能。